Мне в своё время подсказали, что делать, чтобы не писать кастомы для каждого окна. В меню midiEditor есть экшн Misc: Pass through key to main windowСтрашно подумать даже, что прийдется Custom экшны писать дважы, а то и трижды (для Main, Mixer и Piano Roll).
Туда можно забивать хоткеи, которые действуют также, как и в основном окне Main. Все транспортные хоткеи с основного окна я просто перенёс туда.