Насчет ограничения в 0.9 А - это скорее всего ограничение в спецификации, на практике все зависит от того, как на плате все реализовано. При желании, небольшая доработка платы, и все эти ограничения снимаются. Что мне мешает на одном порте перерезать дорожку питания и запитать его напрямую от +5 V блока питания? Тупо прокинуть проводок от контакта разъема АТХ 24 pin? Это конечно вариант мягко говоря, небезопасный, учитывая токи, которые может выдать блок питания по этой линии. Есть вариант запитывания от дежурки +5 В, там обычно максимальный ток на нормальных блоках 2-3 А, что более чем достаточно.
Интересный вариант на мой взгляд, убрать штатное питание порта, и завести +5 В на него от отдельного трансформаторного БП со стабилизацией на выходе. Реализовать совсем несложно, и все вопросы с качественным питание карты снимаются.