В самплитуде несколько вариантов мониторинга... плюс в твоем случае можно еще мониторить все с помошью микшера карты и в самплитуде мониторинг как таковой отключить...
Если использовать мониторинг самплитюдный, то тут зависит какие дрова юзаешь... Asio или Wdm.. Если асио, то в разделе аудио настроек можно выбрать тип мониторинга - хардверный, (тогда он автоматически задействует микшер карты)... обычный софтовый, либо Fx мониторинг...
В общем опиши подробнее чего как... там много вариантов... под рукой самплы нет... поэтмоу в общих словах... но если напишешь чего у тебя и как настроено... то подскажу... у меня у самого Rme... работает все великолепно на всех видах мониторинга... для разных задач использую разные режимы...