короче, при определенных настройках (не знаю, каких) у меня кривой квантайз связан с тем, что записанный миди-айтем сдвинут относительно сетки вперед или назад на пару тиков, из-за этого квантизация не в сетку тоже происходит. Нарисованный айтем четко на сетке стартует. И повторюсь, в чистой установке этого бага нет.
У себя могу грешить лишь на то, что конфигурацию тяну еще с 4 версии, пару раз на рабочую конфигурацию ставил пререлизы, мог где-то что-то похерить, а собирать с нуля влом.
UPD2: переместил из рабочей конфиги с багом reaper.ini в другое место - баг пропал.