подобная проблема. все то же самое, только iMac 7,1.
даже если не запускать Logic (репродюсится в Itunes, VLC), через время появляются щелчки, помехи, звук значительно ухудшается. помогает перевыбор частоты семплирования (или выбор другой) в USBAudioControlPanel. причем заметил интересный...