Проблемы бывают со всеми интерфейсами - из-за древнего "железа", старых драйверов, из-за засоренной системы, из-за "кривых рук", из-за желания навешать на рабочий компьютер кучу варезного игрового софта, из-за неподходящего pci-firewire контроллера и т.д. У людей и USB и Firewire интерфейсы работают нормально при грамотной настройке. Сейчас в основном USB 2.0 интерфейсы, на которых проблемы наблюдаются гораздо реже (я на своем не наблюдал), чем на USB 1.1. Но и с 1.1 люди работали и работают, и с Firewire, подобрав подходящий pci-контроллер. Бери любой понравившийся интерфейс отвечающий твоим требованиям (количество вх/вых, характеристики и т.д.) и возможностям.