"Когда вы говорите, Иван Васильевич, впечатление такое, что вы бредите!"(с)В рипере, сразу не ресемплится, таким и остается, смотрите картинку выше. Проект отдельно, файлы отдельно, дайнсемплинг в процессе.
Смотрим картинку выше.
Частота сэмплирования проекта 44100Hz.
Видим, что закинуты в проект два аудио трека, первый с ЧД 44100, второй - 96000.
На втором видим параметры источника, и частично айтема.
Где слева от "sinus96000" в красном прямоугольнике, синеет "i" - уведомление Рипер.
Если на него навести курсор, появится "Resampled from 96kHZ".
Во что? В частоту сэмплирования проекта, во что ж ещё, - 44100Hz.
Смотрим дальше.
Меню Playback resample mode/Render resample mode (режимы ресэмплирования при воспроизведении/рендеринге) оставлено дефолтным, с мид ресэмплерами. Что с этим воспроизводится и рендерится - не айс, мягко говоря.
Можно канеш и всё в Рипер дефолтным оставлять, но как уже говорил, здесь однозначно лучший r8brain-free-src.
Разница то между r8brain и 768pt существенна, не в пользу второго, не говоря про остальные.
Что там у вас про "проект отдельно, файлы отдельно, дайнсемплинг в процессе" - не осилил. Сил нет.
Завязывайте уже..