А что за движение в партии гитары? равномерные 8, 16-ые или по сложнее что-то?
Когда-то мне очень помагал следующий способ, правда только на аккордеоне, но возможно на гитаре суть не изменится.
Нужно играть в медленном темпе очень сильно акцентируя ноты попадающиеся на сильные доли - ну это четверти в основном. При этом не обращать внимания ни на динамику ни на фразировку: подошла сильная доля и давишь/цепляешь ноту что есть мочи. Но очень важно что-бы движения при ударах были короткими, чёткими и очень энергичными, без всяких там излишних замахов и прочих размашистых приготовлений. И конечно вслушиваясь в метроном стараться чтобы эти резкие удары совпадали с четвертями метронома (в медленном темпе правильно попасть на четверть уже не должно быть проблематично). Вот так тупо долбить партию раз 20-30. Звучать будет ужасно, но об этом беспокоится нужно меньше всего - такое ненатуральное исполнение не заучивается и после 100 проигрываний, проверено не раз. Ну а потом, абсолютно забыв и не думая о той долбёжке, можно пробовать 2-3 раза сиграть натуральным образом с фразировкой, динамикой и прочими прелестями. Репетировать каждый день. В основном где-то после недели таких репетиций дела с ритмом и пульсацией поправляются.
Попробуйте так попахать на совесть. Может получится.