ничего нет проще:
прописываете все треки в секвенсере МЗ.
на треках, которые будет играть ямаха, в настройках секвенсера отключаете тон-генератор МЗ - это нужно делать в режиме секвенсера на странице, где треки назначаются на выходы и инсерты (точное обозначение страницы не скажу - МЗ продал недавно).
если на ямахе будет проигрываться несколько треков, нужно создать в ней перфоманс. каналы, что не используются, нужно будет замьютировать.