MPEGVideoWizard отлично это делает. Кстати, не MPEGVideoWizard DVD, а просто MPEGVideoWizard.
В верхнем окошке выбираешь пункт "Tools" - далее "Mpeg Demultiplexer", в появившемся окне выбираешь в строке Input file свой файл и жмешь внизу кнопку Save. В той же папке получаешь элементарные потоки видео и аудио.
Судя по всему, ты закинул свой файл на таймлайн и оттуда экспортировал его.
Так немного сложнее получается, но можно и так.
Опять-таки из верхнего окна выбери "Export", в появившемся окне в закладке General - File Format у тебя по умолчанию стоит Mpeg-2 Program, там выбери Mpeg-1 Audio, перейди на закладку Audio и убедись или поставь сам птичку на АС3. Далее экспортируй, даже если расширение и будет отличаться от АС3, то поменяй его на это расширение.
Если захочешь обратно засунуть звук, то В верхнем окошке выбираешь пункт "Tools" - далее "Mpeg Multiplexer" а дальше думаю, все ясно?