Может я не понял чего-то. Ну, если под другим, конечно именем сохранять, то только ещё один файл cwp в папке проекта появляется. Если в другую папку сохранять, то в неё копируются вавки и добавляется папка Audio. Если галку не ставить, то этой папки не будет и проект будет брать аудио из старого...