У вас из хоста клок в виде Midi sync раздаётся, SPP, MMC? В кубазе3 это меню Transport > Syncronization setup. Там включаете что-нибудь из Midi machine control, Midi timecode, midi clock destinations (я бы рекомендовал начать с последнего)...
Я вирусом давно не пользовался. Как мне проверить...