Работать будет, но количество каналов по ASIO будет ограничено раза в три, даже с PCI слотами на материнских платах новее 4го чипсета, как раз потому, что их PCI слоты сделаны через бридж на PCIe.
Все 64 канала в обе стороны держат только старые материнские платы, на которых PCI шина сделана...