Причину рассинхрона выявил, Nuendo не причем, дело в переферийном оборудовании, а конкретно - монитор выводит изображение с задержкой.. Я раньше на этой студии работал, стоял плазменный монитор и проблем не было, видимо его задержка была несущественной.. Видимо поэтому в самую последнюю очередь...