Так, ребята, кажись я офигенно протупил...
Только что ещё раз проверил всю процедуру:
в Project settings включил опцию сохранять маркера;
включил запись, нащелкал 3 маркера;
нажал стоп;
не сохраняя проект и не рендеря ничего просто сдвинул (и удалил) маркера, а под ними, оказывается, уже есть...