Это не глюк, а особенность работы FFT спектроанализаторов (да и не только FFT). Чтобы синусоида выглядела на них острым пиком, нужно соблюсти два условия:
Длина синусоиды должна быть больше выбранного размера FFT, чтобы в окно анализа попала только синусиода и ничего более. Курсор надо...