Я так понимаю, что ломает сам процесс миксдаунить? Наверное
или много однообразных телодвижений получается, или долго
ждать, и при этом требуется присутствие оператора - так?
Тогда идея такая - пишите два микрофона в один стереотрек,
на разные каналы (это кубейс позволяет, разумеется), а затем
воспользуйтесь пакетной обработкой в аудиоредакторе.
Загружаете записанные кубейсом треки в аудишн, например,
и запускаете сценарий, который конвертит все файлы в моно
(микшируя их, естественно) и сохраняет их, и идёте курить -
дальше всё сделается само без вашего участия