Вообще по логике, в нюхе кажется есть настройки кэша памяти, сколько выделить на каждый трек буфер. В кубе по крайней мере точно были. Раз она жалуется на то что "треков слишком много", значит скорее всего ей не хватает выделенной оперативной памяти. Отсюда глюки и тормоза и всё такое, по симпотомам похоже. Скорее всего как-то нарушилось выделение памяти приложениям, что-то отбирает память у нюхи, осталось понять что. Вирус, неисправность железа или что еще. Во всяком случае это кажется не винда, раз перестановка не помогает.
Я бы для начала при работающей нюхе запустил диспетчер задач и на вкладке "быстродействие" посмотрел бы загрузку процессора, доступную память и состояние файлов подкачки. Потом на вкладке "процессы" поглядел бы, какая программа жрет память и ресурс процессора. Может какая-то служба сбесилась и грузит комп. Некоторые вирусы так делают, маскируясь под системные процессы, это я слышал не раз.