Вероятно вы раньше видели окно системных настроек Apollo Console пр работе Apollo с PCI Express ядром, подключенных по Thunderbolt
Сейчас вы пользуетесь Apollo с подключением по IEEE1394 и в этом режиме архитектура ядра ввода-вывода Apollo иная, независимо от платформы (Mac или PC). При "откате в классику" (ядро FireWire) все функции Apollo Expanded, появившиеся после реализации истинной PCIe архитектуры по Thunderbolt в Console 2.0, недоступны аппаратно - сам интерфейс IEEE1394 этого не позволяет
Вот мануал, которым вам нужно руководствоваться:
http://media.uaudio.com/support/manuals/v9100-vp4lQz6/Apollo Software Manual - FireWire.pdf
I/O Matrix в Apollo Console строго говоря не является средством "маршрутизации", это единственный в своем роде и очень удобный инструмент (у других производителей такого нет), который позволяет прямо на уровне Core Audio и/или ASIO нужным образом переименовывать входные и выходные канальные пары, "видимые" драйверу, как угодно менять жесткий стандартный порядок их следования в DAW, а если нужно часть из них вовсе делать для DAW невидимыми, но при его отсутствии возможности выбора всех физических и внутренних "виртуальных" входов-выходов Apollo, строго говоря, ничем не ограничены
Работая с FireWire Apollo Console, просто смотрим таблицу соответствия входов и выходов, доступных в драйвере при выборе нужных каналов ввода-вывода в DAW:
http://media.uaudio.com/support/manuals/v9100-vp4lQz6/Apollo Software Manual - FireWire.pdf#p187
При установке в имеющийся Apollo Silverface опции Thunderbolt и активации ядра PCI express все функции Apollo Expanded будут одинаково доступны как под Mac OS так и под Windows