При полной резервной копии в iTunes (включае программы) с авторизацией компьютера - сохранится всё что есть
Так же можно сделать дополнительную копию нужной программы с помощью iTools (есть и под мак и под окна), очень интересная софтина кстати ; )
Чот не помню копии в АйТулз.