Попробуй FMJ Awave Studio(по-моему правильно написал)
Конвертит все и во все. Только я ее на счет глюков не изучал,
т.к. пользовался мало.
И еще надо при конвертации смотреть вот что-
включена ли функция Split stereo chanels(или как-то так).
Как раз она и влияет, будут ли совпадать луп-зоны.