Вроде решил проблему:
Поставил на всех вкладках (трек, мультитрек, 5,1) ASIO дрова на 44100. Также нашел, что Adobe Premiere CS3, который у меня стоит, также использует собственный драйвер. Перевёл Премьер также на Asio. Ну и пока работает, по крайней мере конфликта частот сейчас не наблюдаю.