В целом загрузка не такая уж и долгая. Но если хотите ускорить процесс, то попробуйте следующее:
1. Установите FL на SSD, а сторонние плагины пусть останутся на HDD. Просто укажите в DAW путь к папке со сторонними плагинами.
2. Если сторонних плагинов очень много, то сократите их количество...