aqer1, проанализировав кучу подобных постов и свои баги, связанные с падением или зависанием safari именно при работе с видео, все больше прихожу к выводу - что возможна проблема то не в сафари а во flash.
Причем подобные проблемы с флешем возникают не только на El Capitan, проблемы есть и на...