Вообщем при создании образа, Ghost 2003 (dos, boot cd) подвешивает систему и убивает часть файлов на target для образа. Почитав про это, нашёл, что контроллер SATA необходимо перевести в Compatible mode. На новых материнках этого выбор уже нету, т.к вроде бы авто, но если хотя бы один винт висит...